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Q1：增值税发票抵扣联丢了怎么办
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》（附件5），经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查；如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证，专用发票发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
第二十九条 专用发票抵扣联无法认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证。专用发票发票联复印件留存备查。
Q2：增值税发票丢失了，要怎么处理后续问题了？
一、根据《国家税务总局关于修订<增值税专用发票使用规定>的通知》（国税发[2006]156号）第二十八条、 一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查；如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证，专用发票发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
值得注意的是增值税专用发票开出超过三个月的，则不可以通过认证。因此需要到主管税务局咨询，是否可以在媒体上刊登遗失发票声明，将原发票作废后，再重新开具新的发票。当然那样做是有部分罚款的。
二、根据《税收征收管理法》、《发票管理办法》规定
关于被盗、丢失增值税专用发票的处理：
1、向当地主管税务机关、公安机关报失，缴纳“挂失登报费”。
2、处以1万元以下罚款。
Q3：增值税发票怎么办理？
您问的有些简单，根据您的意思您大概在问如何申请增值税专用发票是吗？如果您是新办企业，您需要到工商局先办理工商营业执照，再到税务局备案采集信，作税种登记。然后才可以申请增值税专用发票。据我所知，目前微信公众号还不能直接受理增值税专用发票的申请审批。
首次申请增值税专用发票，需要作增值税专用发票核定。纳税人需填写《纳税人领用发票票种核定表》两份，提供社会信用统一代码证，公章。首次办理需提供经办人身份证原件及复印件，还有发票专用章章。
其次作增值税专用发票最高开票限额的申请。需要填写《税务行政许可申请表》、《增值税专用发票最高开票限额申请单》以及公章。
申请限额百万元的增值税专用发票，需税务人员下企业实地调查，集中审批通过后方可领用。部分限额十万元的增值税专用发票份需审批。实名采集法人的非风险行业一般纳税人法人本人办理申请限额十万的专用发票受理即办。
第三，审批通过后，纳税人就可以购买税控设备。也就是税控盘或金税盘，价格200元，服务费280元。这480元可以抵减税收。
第四，前台人员会给出具《税务事项通知书》，纳税人携带金税盘或税控盘作初始发行。然后就可以领用发票，在电脑上安装防伪税控系统开具增值税专用发票啦。
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Q4：增值税发票遗失怎么办
根据《国家税务总局关于增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票有关税务处理问题的通知》（国税发〔2002〕10号）的规定
1. 纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前已通过防伪税控认证系统的认证，购货单位可凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位的主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额；
2. 如果该发票丢失前未通过防伪税控认证系统的认证，购货单位应凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件到主管税务机关进行认证，认证通过后凭该发票复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。
Q5：增值税发票丢失补抵又找回，应如何处理原发票？
思忖题主的意思，应该是开具的发票找不到了，在使用复印件或者记账联抵扣了以后，又找到了，该如何处理原发票。
增值税专用发票，有两种形式，一种是电子版，存在于开票方的金税三期开票系统里面，一种是纸质版，纸质版又分为抵扣联和记账联，给购货企业。纸质发票不过是电子发票的载体，主要的用途就是购货方的购货凭证和完税凭证。鉴于现在的技术，电子发票还不能实现与货同行，只能凭借纸质发票流传使用。一旦有一天，电子发票可以像纸质发票一样畅通无阻了，也许纸质发票就取消了。
只要发票是真的，即使丢失了发票的抵扣联，还是可以认证抵扣的。比如跟开票企业要一张丢失发票的复印件，或者用记账联去认证抵扣。认证发票现在信用级别高的企业可以勾选认证，非常方便，即使去扫描认证，复印件也是可以的，如果扫描认证也不行，手动输入密文进行手工认证也是可以的。这一些操作只有一个前提，发票是真的。
一般抵扣联是要留存待查的，应该将每月的抵扣联加上专门的封面封装起来，记账联可以作为原始凭证，附在记账凭证的后面。
丢失并不影响发票的认证，但增值税专用发票是很重要的凭证，应该妥善保管，尽量避免不要出现这样的情况。